Ressources matérielles

Le mésocentre met à disposition de ses utilisateurs 31 To de mémoire, 1,3 Po de stockage et une puissance de calcul de 338 Tflops/s fournie par 5236 cœurs (nœuds fins, nœuds à forte mémoire (SMP), nœuds GPU et nœud dédié au calcul sur carte Xeon PHI).

Deux générations de cluster coexistent.

Le cluster le plus récent, très performant, a été déployé en 2018 au travers d’un projet partiellement financé par l’Union européenne avec le Fonds Européen de Développement Régional (FEDER). Il est interconnecté par un réseau rapide faible latence Omnipath à 100 Gb/s. Il accède à un espace scratch de 535 téraoctets (technologie BeeGFS) et à un espace de stockage perenne de 440 Téraoctets (technologie NFS). Il est constitué de :

Noeuds de calcul Sky Lake :
Dell PowerEdge C6420
  • 112 noeuds Dell PowerEdge C6420 ;
  • 32 coeurs par nœud, processeur Intel® Xeon® Gold 6142 (Sky Lake) à 2.6 GHz ;
  • 192 Go de RAM par nœud;
  • 100 Go sur disque local SSD.
Noeuds de calcul GPU :
GPU
  • 7 noeuds Dell PowerEdge C4130 (24 coeurs par noeuds) Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2680 v3, 320 Go de RAM par noeud et 2 cartes bi-GPU NVIDIA Tesla K80 (4992 cœurs CUDA);
  • 2 noeuds Dell PowerEdge C4130 (28 coeurs par noeuds) Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2680 v4, 320 Go de RAM par noeud et 2 cartes NVIDIA Tesla P100 (3584 coeurs CUDA).
L’ancien cluster, dont les ressources peuvent toujours répondre à plusieurs types de calcul, notamment ceux nécessitant beaucoup de mémoire ou du calcul sur Xeon Phi, reste accessible à travers l’ordonnanceur SLURM.

Les premiers équipements ont été installés en 2012. Une première extension matérielle a été réalisée en 2013, en partie grâce à des machines issues de la mutualisation des moyens de calcul avec l’Ecole Centrale (projet ANR CAPSHYDR). D’autres équipements, acquis dans le cadre de projets ANR ou A*MIDEX, ont été ajoutés au fil de l’eau.

Tous les nœuds du cluster accèdent à un espace scratch d’une capacité de 300 téraoctets (technologie GPFS) et la majorité d’entre eux est interconnecté par un réseau rapide faible latence Infiniband QDR Qlogic.

Symmetric multiprocessing (SMP)
Bullx S6010
  • Bullx S6010 ;
  • 128 coeurs : Intel(R) Xeon(R) E7-8837 à 2.67 GHz ;
  • 2 To de RAM.
images/Dell-R720
  • 3 Dell R720 ;
  • 20 cœurs par nœud : Intel(R) Xeon(R) E5-2670 à 2.67 GHz ;
  • 512 Go de RAM.
Calcul sur carte PCI
Inter-Xeon-Phi
  • SuperMicro 7047GR-TPRF
  • Processeurs Intel(R) Xeon(R) E5-2670 à 2.60GHz.
  • 4x cartes Intel Xeon PHI
Noeuds de calcul Westmere
Dell PowerEdge C6100
  • 95 Dell PowerEdge C6100 ;
  • 12 cœurs par noeud processeur Intel(R) Xeon(R) X5675 (Westmere) à 3.06 GHz ;
  • 24 Go de mémoire par nœud;
  • 80 Go sur disque local SSD.
Noeuds GPU
GPU
  • SuperMicro 7047GR-TPRF : 16 coeurs Intel(R) Xeon(R) E5-2670 et 4 cartes graphiques NVIDIA Tesla K20Xm (2688 cœurs CUDA)
  • SuperMicro 7047GR-TPRF : 20 coeurs Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2670 v2 et 4 cartes graphiques NVIDIA Tesla K20Xm (2688 coeurs CUDA)
  • 2028GR-TRH : 24 coeurs Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2690 v3 et 5 cartes graphiques NVIDIA Tesla K40M (2880 coeurs CUDA)


Partenaire du projet  

Equip@Meso

mesocentre-techn@univ-amu.fr

+33 (0)4 13 55 12 15 / 55 03 33

                                     Dernière mise à jour : 3 octobre 2018